三氮唑在環(huán)肽中的應(yīng)用及結(jié)構(gòu)分析
在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)中,約有四分之一的蛋白質(zhì)(多肽)包含至少一個(gè)二硫鍵。被二硫鍵限制結(jié)構(gòu)的多肽通常具有更好的化學(xué)穩(wěn)定性、代謝穩(wěn)定性,以及更好的跨膜運(yùn)輸能力和更強(qiáng)的底物親和力,因此,環(huán)肽是當(dāng)前藥物開發(fā)的熱點(diǎn)。然而,生理?xiàng)l件下谷胱甘肽、血清白蛋白等硫醇化合物或氧化還原酶等物質(zhì)對(duì)二硫鍵的還原會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)構(gòu)象改變,進(jìn)而失活或發(fā)生代謝降解,限制了環(huán)肽作為藥物研發(fā)的潛力。
以結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的化合物取代二硫鍵是解決其氧化還原不穩(wěn)定性的方法之一。本文中,澳大利亞昆士蘭大學(xué)的DavidJ. Craik教授等通過(guò)骨架環(huán)化和RuAAC交聯(lián)反應(yīng)將不同結(jié)構(gòu)的三氮唑作為二硫鍵模擬物引入環(huán)肽,合成了一系列活性絲氨酸蛋白酶抑制劑,并對(duì)蛋白酶-抑制劑復(fù)合物結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)表征。
:含三氮唑(藍(lán)色)和二硫鍵(黃色)的環(huán)肽在晶體結(jié)構(gòu)上高度吻合
向日葵胰蛋白酶抑制劑(sunflowertrypsin inhibitor-1, SFTI-1)是迄今為止發(fā)現(xiàn)的抑制活性較高的天然胰蛋白酶抑制劑(Ki< 20 pm),屬于Bowman-Birk抑制劑(BBI)家族,由14個(gè)氨基酸(GRCTKSIPPICFPD)和1個(gè)二硫鍵組成。由于 SFTI-1具有小、完整的環(huán)狀多肽結(jié)構(gòu),因此以它為模板研發(fā)新型高效的抑制劑已成為藥物研發(fā)的一個(gè)重要方向。作者以SFTI-1為模型蛋白,設(shè)計(jì)不同結(jié)構(gòu)的橋連三氮唑取代二硫鍵,并探究其對(duì)SFTI-1活性的影響。
RuAAC(釕)和CuAAC(銅)均可催化疊氮對(duì)末端炔烴的環(huán)加成,分別得到1,5和1,4-二取代-1,2,3-三氮唑?;诖?,作者利用SPPS合成了不同原子數(shù)目和唑環(huán)方向的環(huán)肽1b,1c(1,5-三氮唑)和1d,1e,1f(1,4-三氮唑)。對(duì)以上5種變體進(jìn)行胰蛋白酶抑制活性測(cè)定,作者觀察到1,5-三氮唑變體(1b-1c)表現(xiàn)出比1,4-三氮唑變體(1d-1f)更強(qiáng)的抑制活性。其中,1b相比于原始SFTI-1(1a)活性約有5倍的降低,表現(xiàn)出了高程度的二硫鍵模擬。
除胰蛋白酶外,改造后的SFTI變體2a,3a,4a可分別作為人激肽釋放酶7(KLK7)、纖維蛋白溶解酶(plasmin)、蛋白裂解酶(matriptase)的蛋白酶抑制劑。類似前述的合成和活性測(cè)定實(shí)驗(yàn),作者篩選出三種變體2b(KLK7),3b(plasmin),4b(matriptase),可針對(duì)三種蛋白酶實(shí)現(xiàn)有效的活性抑制。由此,作者共得到四種引入橋連三氮唑的蛋白酶抑制劑(1b-4b)進(jìn)行下一步研究。